Karel Valter sa narodil v roku 1980 v Prahe. Študoval flautu a dirigovanie na Pražskom konzervatóriu, priečnu flautu na Schola Cantorum Basiliensis a dirigovanie na Hochschule v Lucerne.
Pravidelne vystupuje ako sólový flautista so súborom Café Zimmermann, barokovými orchestrami La Cetra a Capriccio a s Benátskym barokovým orchestrom. V oblasti komornej hudby má záľubu v literatúre pre priečnu flautu a gitaru zo začiatku 19. storočia. Jeho koncerty boli nahrávané pre vysielanie mnohých európskych rozhlasových sietí a vydané na CD vo vydavateľstvách Tudor (Švajčiarsko), Deutsche Grammophon a Ars Produktion (Nemecko).
Ako dirigent pôsobil okrem iného v Bazilejskom divadle, v Teatro Arriaga Bilbao, v Orquesta Barroca de Sevilla, Orquesta Ciudad de Granada a La Cetra.
Karel Valter prevádzkuje nahrávacie štúdio špecializujúce sa na starú hudbu vo Waldenburgu (Švajčiarsko) a pôsobí aj ako producent CD pre rôzne orchestre, súbory a vydavateľstvá.